本发明属于数据处理技术领域，特别涉及一种基于FFT变换的波形数据压缩方法，包括以下步骤：步骤1、将原始波形数据通过傅里叶变换得到频谱数据；步骤2、对频谱数据处理，得到特征频谱数据；步骤3、记录特征频谱数据的数值、相位及频率，形成谱线群；步骤4、对谱线群进行反傅里叶变换，得到原始波形数据，本发明的基于FFT变换的波形数据压缩方法，利用傅里叶变换进行波形数据压缩，其压缩比为20*3/(4*256)，约5.85%，可大大降低波形数据的传输及储存量，同时也能够满足振动、摆度及压力脉动分析要求。