本发明提供了一种时钟源的调试方法，其特征在于，应用于任意波形发生器板卡，包括：A1：获取参考时钟输出的低频时钟信号和时钟源输出的高频时钟信号；A2：分别对低频时钟信号和高频时钟信号进行分频，得到低频时钟信号的第一分频信号和高频时钟信号的第二分频信号，其中，第一分频信号的时钟频率和第二分频信号的时钟频率的差值在第一范围内；A3：根据第一分频信号和第二分频信号，确定是否需要对时钟源进行调频处理，如果是，执行A4，否则，执行A5；A4：对时钟源进行调频处理，将调频处理后的时钟源作为时钟源，返回A1；A5：将时钟源输出的时钟信号输送给目标设备。本方案能够提高时钟源的调试效率。