本发明公开了一种基于双空间载频技术拓展OCT成像深度的方法与系统。在傅里叶域OCT系统中设置两个具有不同光程的参考臂，分别与不同深度位置的样品光信号发生干涉。在两个参考臂中各自设置一套扫描振镜系统，使两个参考臂中的光束在扫描振镜上的入射位置相对于扫描振镜的旋转轴具有不同的偏移量。通过同步控制电路使样品臂和两参考臂中的扫描振镜同步扫描。由于两参考臂中扫描振镜的空间相位调制作用，使对应于样品两个深度位置的干涉光谱信号分别被加载到不同的横向空间频谱频带。通过计算机对探测到的调制干涉光谱信号进行解调处理，获取两帧对应于样品不同深度位置的OCT图像，继而通过简单拼接即可实现OCT成像深度的成倍拓展。