本发明属于网络数据传输技术领域，公开了一种MPTCP网络多路径组合选择系统及方法，根据当前数据流需要传输的数据大小将传输的数据流分类；将网络中的所有子流路径放入初始路径集中，发送端每收到1个ACK数据包便实时更新路径的往返时延，根据路径的当前往返时延和子流影响因子由小到大进行排序；再根据数据流所属的类别进行路径选择。本发明将传输数据的大小、子流的影响因子结合起，有选择性地利用部分子流进行网路传输；对网络资源充分利用，提供更好的网络服务。本发明提高了MPTCP在异构网络传输中的性能；提高了异构网络中MPTCP传输较小数据时的网络性能；节省了计算机的计算资源；更加有效的利用网络资源。