本发明提出了一种机组自启停控制系统，包括：启动控制级组和停止控制级组，将启动指令或停止指令发出；功能级组，用于接收并执行启动或停止控制级组发出的启动指令或停止指令，若功能级组可以执行该启动指令或停止指令则将该启动指令或停止指令传送；子功能级组，用于接收并执行功能级组发出的启动指令或停止指令，若子功能级组可以执行则将该启动指令或停止指令传送至下一级；设备级组，用于接收并执行子功能级组发出的启动指令或止指令，若设备级组无法执行该启动指令或停止指令则产生反馈指令并传送给子功能级组，若设备级组可以执行该启动指令或停止指令则设备级组启动或停止，借此，本发明具有方便控制发电机组中各个设备启停工作的优点。