本发明涉及一种用于优化选取脑卒中相关生物标志物的方法，主要分为两个环节，第一个环节是诊断患者是否患有脑卒中，第二个环节区分得有脑卒中的患者患的是哪一种脑卒中。每个环节中，先通过互信息分析，分别分析出和患病与否，患哪种脑卒中的互信息值，并以此为进行筛选。再运用主成分分析，减少信息的冗余，最后用支持向量机的方法对筛选出的生物标志物进行调整修正，来完成整个优化选取过程。本发明减少了信息的冗余浪费，实现了对选取结果的修正；减少了生化检测的种类项目，降低诊断成本，提高诊断的正确率，同时可实现脑卒中风险的预判；提供了一种处理生物信息的普遍手段，对于其他疾病的生物标志物信息可使用同样方法进行优化选取。