本发明公布了一种基于ＦＰＧＡ的交流同步电机控制器及其控制方法，本发明利用ＦＰＧＡ同时进行编码器、电流传感器反馈数字处理以及对当前电机运行控制；同时在电流反馈传感器数字滤波中减小了由于反馈电流值的系统误差以及共模抑制比造成的动态误差；并且在反馈环节利用数字滤波后的极性占空比代替反馈电流值进行线性数据转换因此避免电流值转换过程中的非线性处理以及乘法计算中带来的数据误差；在电流环和速度环的数据逻辑计算与处理过程中利用数据的绝对值和符号位作为数据组合，简化了编程设计的数据处理；另外在速度环与电流环之间的控制与刷新过程中提供统一的同步时钟使得由电流环与速度环计算控制时数据传输过程中由于时序问题造成的误差得以消除。