渠道边坡藻泥生态清除作业船，包括船舶，船舶的甲板上安装有柴油机、液压动力装置、机械手臂架、高压水泵、吸污泵、藻水分离装置、沉淀箱、清水箱和收污箱；沉淀箱的上部通过清水管与清水箱连接，清水管上设置有过滤器。本发明采用水下空化射流清除工艺，通过渠道边坡藻泥生态清除作业船的行驶驱动，带动空化射流清洗小车完成藻泥生态清除任务，通过吸污泵，将藻泥混合物吸到藻水分离装置进行分离，分离后的藻泥进入收污箱，过滤后的污水进入沉淀箱，泥沙沉淀后，清水经过滤器过滤后，首先给清水箱注水，清水箱注满溢出部分放回渠道。本发明以具有作业效率高、环保节能、安全可靠的优点，能够根除边坡生长的藻类，且对水质不会产生二次污染。