本发明公开了一种垂直巴氏灭菌槽，该巴氏灭菌槽包括距动链条一，距动链条一与动力气缸一连接，其前端左侧面和后端分别设有检测器一和检测器二，检测器二上方设有机械手臂支架一，机械手臂支架一上设有机械手臂一；距动链条一后端右侧设有灭菌槽，灭菌槽内部设有距动链条二，灭菌槽下侧面设有蒸汽加热装置及动力气缸二，灭菌槽右侧设有距动链条三，距动链条三连接动力气缸三，距动链条三上方且与机械手臂支架一对称的位置设有机械手臂支架二，机械手臂支架二上设有机械手臂二。本发明充分的利用巴氏灭菌槽里的灭菌空间，减少加热水的蒸汽使用，从而节省能源，其灭菌后的产品不会出现表面有斜度和封口膜内有附着物的情况。