本发明公开了一种直流电机传感器故障检测及保护系统，包括瞬态保护电路；所述瞬态保护电路的输出端连接有第一滤波电路，瞬态保护电路用于将采集到的电机霍尔位置信号进行瞬态保护；所述第一滤波电路的输出端连接有光耦电路，光耦电路的输出端连接有第二滤波电路；所述第二滤波电路的输出端连接有CPLD芯片。本发明用于对航空大功率无刷直流电动机转子位置传感器检测及故障保护，能够判断出电机霍尔传感器不同种类的缺相模式，并对当故障发生的次数累加到一定数值时，快速保护航空大功率无刷直流电动机避免过电流损坏。