本申请提供一种投资银行工作底稿管理方法及系统，方法用于对投资银行的工作底稿管理，包括：根据由处理人员对文件夹的选择操作而生成的指令，确定出待上传文件夹，其中，待上传文件夹中包含多个工作底稿；从投资银行工作底稿管理系统中确定出与待上传文件夹对应的工作底稿目录，以及，将待上传文件夹中每个工作底稿上传至工作底稿目录下；获取多个工作底稿中任一个工作底稿的审核通过指令或者文件退回指令，并根据审核通过指令，对该工作底稿进行归档，或者，根据文件退回指令，向处理人员发送表示需要对该工作底稿进行修改的提示信息。这样可以实现工作底稿的批量上传，大大提高上传效率，进而实现对投资银行的大量工作底稿的有效管理。