本发明实施例提供了一种列车进站时间预测方法及系统，当目标车站内目标车次窗中的每一车次对应的列车为通信列车时，根据列车在目标车站的前一车站的实际出发时刻、在目标车站的预测到达时刻以及列车运行图中列车在前一车站的计划出发时刻、在目标车站的计划到达时刻，确定当前时刻列车运行的时间偏移量；并根据计轴设备获取的列车信息，对时间偏移量进行调整，预测出列车在目标车站的进站时刻。该方法通过确定时间偏移量，并引入计轴设备获取的列车信息，对时间偏移量进行调整，可以实现对列车进站时刻进行准确的预测，进而提高列车的运营效率。而且，以北京时间作为基准，预测列车进站时间，可以保证预测结果的可靠性。