一种提高油用牡丹籽含油率的转基因方法，属于生物工程领域，该方法首先构建多基因植物表达载体，然后通过根癌农杆菌将其转入到牡丹植株组织中表达并遗传，其中，所述多基因植物表达载体的构建是在pBI1211‑GUS上35S启动子的3’末端引入一个多克隆位点，构建载体pBI121‑35S MCS，再将外源基因WRI1、LEC2和FAD2依次插入到pBI121‑35S MCS中，构建形成多基因植物表达载体pBI121‑WRI1‑LEC2‑FAD2。该方法已构建的多基因植物表达载体为基础，使其能够在牡丹植株中有效表达，收获的牡丹籽能够稳定遗传且含油率高。