本发明涉及水稻稻瘟病广谱抗性基因Bsr‑d1的功能特异性分子标记，属于生物工程技术领域。用2对特异扩增水稻稻瘟病广谱抗性基因Bsr‑d1及其感病等位基因bsr‑d1的PCR分子标记引物，其中Bsr‑d1和bsr‑d1正向共用引物Bsr‑d1‑F，Bsr‑d1反向引物3Bsr‑d1‑R，bsr‑d1反向引物3bsr‑d1‑R，通过同时进行2次PCR不仅能简单、快速、准确地鉴定水稻种质资源或其育种群体中是否含有稻瘟病广谱抗性基因Bsr‑d1，同时能进一步区分Bsr‑d1基因的纯合体和杂合体，预测后代基因型，大大提高对水稻稻瘟病抗性的选择效率，加速育种进程。