本发明涉及微生物发酵领域，公开了一种丁酸梭菌高密度连续发酵的方法及丁酸梭菌微生态制剂的制备方法。本发明首次采用多级连续发酵，将上级发酵罐中的发酵液以每小时5～10％发酵罐体积的速度放出到下级发酵罐中，通过补加发酵培养基或补料培养基，控制各级发酵罐中的残糖浓度，直至最后一级发酵罐中的残糖在15％以下时，放出发酵液即为丁酸梭菌菌液。将丁酸梭菌菌液于载体一起真空搅拌干燥，得到丁酸梭菌微生态制剂。本发明高密度多级连续发酵的方法能够控制各级发酵罐中菌体的生长速率与菌体密度，最大限度的降低了代谢产物的累积，促进丁酸梭菌在发酵后期的进一步生长，得到的丁酸梭菌菌液菌体浓度达到1011cfu/ml以上。