本发明公开一株防治棉花黄萎病的拮抗菌Z‑18及应用，基于植物内生菌与植物共生体的关系，在棉花中分离出一批内生菌的菌株，从中筛选出一株遗传特性稳定，生防性好的芽孢杆菌（Bacillus zhangzhouensis）Z‑18 CGMCC No.15006，筛选出的编号为Z‑18的内生菌菌株在棉花黄萎病生物防治中应用时，能降低棉花黄萎病的病情指数，防效为59.5%，对棉花主要棉花黄萎病有很好的防治效果，并且与对照存在显著性差异（P＜0.05），成为一种防治棉花黄萎病的新途径，有利于提高棉花的产量和品质。