本发明公开一株用于土壤改良的高效溶磷菌及其应用，属于微生物工程技术领域。所述菌株为Pseudomonas prosekii YLYP6，于2017年06月28日保藏于中国武汉市武汉大学的中国典型培养物保藏中心，保藏编号：CCTCC NO：M 2017390。该菌株补充了溶磷菌的微生物资源库，该菌株培养条件及方法简便易行，且溶磷能力强，能够在较短时间内大幅度提升土壤有效磷含量，且能够在土壤中保持持久溶磷活性，适应能力强，增加土壤中有效磷含量，适应能力强，具有良好的应用潜力，适于作为微生物菌剂应用于农业生产，具有广阔的应用前景。