本发明公开了一种复合微生物土壤修复剂，包括节杆菌(Arthrobacter sp.)LHM7719菌剂、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)菌剂和复合酶；复合酶由甘油醛‑3‑磷酸脱氢酶和β‑淀粉酶构成。本发明还公开了上述复合微生物土壤修复剂的制备方法和应用。本发明将节杆菌(Arthrobacter sp.)LHM7719用于土壤修复领域，且节杆菌(Arthrobacter sp.)LHM7719与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)以及甘油醛‑3‑磷酸脱氢酶配合能够显著降低土壤中重金属砷、铅和镉的含量；与β‑淀粉酶配合能够高效降解土壤中石油烃，具有良好的应用前景。