本发明公开了一种用于土壤修复的微生物制剂，包括多孔载体和负载在多孔载体中的复合微生物菌剂；多孔载体包含硅藻土、硫酸钙和海藻酸钠；复合微生物菌剂包含节杆菌(Arthrobacter sp.)LHM7719菌剂、沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)菌剂和ACC脱氨酶。本发明将节杆菌(Arthrobacter sp.)LHM7719用于土壤修复领域，并与沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)以及ACC脱氨酶复合，得到的微生物土壤修复剂能够调节土壤pH值，改善土壤板结问题，并能够降低土壤中土壤中重金属的含量，降解土壤中有机污染物。