本发明公开了一种用于检测二价汞离子的生物工程菌，所述生物工程菌含有表达载体merRop‑ompA‑rfp‑pSB1A2，其中，merRop‑ompA‑rfp为重组基因，pSB1A2为质粒骨架。本发明还公开了一种用于检测二价汞离子的生物工程菌的制备方法和用途。本发明提供的生物工程菌可以高选择性、高灵敏性的识别并检测水环境中的目标金属离子汞，对0.025μM低浓度金属离子Hg2+已经有明显的响应，而对高浓度的其它金属离子均没有响应。而且，在加入1uMHg2+时，分析不同反应时间中工程菌响应程度，在15min相对短时间内，出现明显荧光强度，随着反应时间的延长，荧光强度逐渐增加。