本发明公开了一种依结构层次制备胎盘组织及冻存的系统方法，包括：(1)胎盘羊膜、蜕膜的分离及冻存；(2)胎盘绒毛膜下大血管组织的分离及冻存；(3)胎盘绒毛膜组织的分离及冻存；(4)胎盘绒毛组织的处理及冻存。本发明还给出了冷冻保存后复苏的方法。本发明将胎盘羊膜、蜕膜、绒毛膜下血管、绒毛膜等组织均分别进行了分离、保存，有利于提高冻存组织和细胞的活性，复苏后形态、功能、结构与新鲜组织一致，组织内细胞总体存活率达90％以上，所保存的组织不但可以用于分离干细胞等领域，还可以用于组织工程移植等领域。本发明提供了一套系统的保存完整胎盘各类组织的方法，为胎盘来源的干细胞研究提供了重要的生物资源。