本发明属于生物降解材料技术领域，公开了一种用于制备育苗容器的水溶致孔性完全生物降解复合材料及其制备方法和育苗容器。本发明复合材料由包括以下重量百分比的组分组成：10～50％聚己二酸/对苯二甲酸丁二醇酯共聚物，5～20％聚乳酸，20～50％热塑性淀粉，20～50％改性甘蔗渣，1～15％水溶性致孔剂，0～5％其他助剂；所述改性甘蔗渣为改性剂改性后得到的甘蔗渣，所述改性剂为γ‑氨丙基三乙氧基硅烷，γ‑缩水甘油醚氧丙基三甲氧基硅烷和马来酸酐的至少一种，改性剂用量为甘蔗渣质量的0.5～2％。本发明还提供一种基于上述复合材料的育苗容器，可应用于花卉、中药材、果蔬等的育苗，有效提高作物的生产和培育效果。