本发明涉及一种模块化生态水产养殖水处理方法，包括以下步骤：通过循环泵将养殖单元内的水排入人工净化模块中进行净化；通过微生物分解鱼类粪便，通过阳光使水藻和水草产生光合作用产生氧气；通过高通量的进水管线和出水管线产生高速水流，并通过诱食剂使鱼群朝着进水管线附近首尾相接的聚集，高速水流顺着鱼头向鱼尾的方向流动，清理鱼身上粘连的粪便，同时将水里的污染物通过高通量管线排入生态净化模块中。该水处理方法可以使高密度的水产逆着高速水流的方向首尾相接，通过高速水流对水产身上的排泄物进行高效率的冲刷和净化，再通过输氧模块的作用使水产在养殖模块内做有氧运动，从而使水产快速生长并且提高了免疫力。