本发明公开了一种肾脏清除的超小双靶向双模态磁共振造影剂的制备方法，属于纳米材料和生物工程技术领域。该方法采用改进的共沉淀法，在氮气保护下制备出琥珀酰超低分子量肝素包覆的水溶性超小四氧化三铁纳米粒子，得到的纳米粒子核平均粒径是2nm，聚合物涂层厚度为1.0nm‑2nm。琥珀酰低分子量肝素上大量的羧基不但能够使氧化铁纳米粒子稳定地分散于去离子水中，而且能够与靶向分子结合，赋予该纳米材料磁性和叶酸双重靶向功能。本发明所合成的具有磁性和叶酸双重靶向复合磁性纳米粒子形貌均一，分散性好，而且生物相容性好，T1弛豫率高，在小鼠体内血液半衰期短，48小时内基本完全排除体外，在不影响小鼠正常生理活动的情况下实现精准靶向肿瘤T1和T2磁共振成像。作为磁共振造影剂，该方法制备出的超小双靶向双模态磁性纳米粒子在磁共振成像、癌症早期诊断、影像跟踪疗效评估等生物医学领域具有广泛的应用前景。