本发明涉及一种精密过滤器的智能消毒工艺，按照先后顺序包括以下步骤：步骤(1)：向精密过滤器中通入热蒸汽，将精密过滤器中的空气分别从排污口和出气口全部排出；步骤(2)：排空精密过滤器1内的空气后，调节压力调节阀，使进气压力保持稳定，在控制压力不变的情况下同时调节空气进气阀和出气电磁阀控制升温；步骤(3)：控制升温至121℃时，再次调节空气进气阀维持温度稳定，保持30分钟即可。本法杜绝了因操作失误造成的滤芯毁坏或消毒不彻底造成的发酵污染，减少重大损失，同时降低了操作难度和劳动强度，减少了安全隐患。