本发明提供了一种固定水体中硝酸盐的制剂，属于污水处理技术领域，所述制剂包括以下重量份的成分：农作物秸秆900～1100份、镁1～2份、锌0.1～0.2份、枯草芽孢杆菌菌剂9～11份，所述枯草芽孢杆菌菌剂中有效活菌数为4×109～6×109cfu/g。本发明采用添加镁、锌元素对农作物秸秆加以改性，可以显著改善枯草芽孢杆菌除了氮素之外的营养物质组成结构，充分满足微生物最大生物量的形成条件。因而通过在改性秸秆中接种枯草芽孢杆菌而得到本发明所述制剂，能够显著提高农作物秸秆对水体中硝酸根的生物吸收与固定速率。此外，本发明操作简单，处理后的制剂可回收用作含氮肥料，无二次污染，具有良好的经济和环境效益。