本发明公开了一种葛仙米粒粒饮料的制备方法，具体步骤包括：葛仙米的采收与选择、葛仙米的离子置换、葛仙米酶的活性钝化、葛仙米杀菌处理、饮料配料、灌装、巴氏杀菌、包装。本发明具有如下的有益效果：用离子置换与葛仙米内部藻蓝素、别藻蓝素、藻红素、味绿素等成分结合，形成稳定螯合物，可以形成稳定的色素。同时通过调节PH值，通过烫漂钝化酶的活性，保证的葛仙米的营养成分特点，使整个产品整体外观晶莹剔透，球体圆润，口感松嫩富弹性。不仅有饮料的解渴、愉快风味，果汁营养丰富等功能，还拥有葛仙米这一天然淡水藻类的有效功能与Q弹口感，晶莹剔透外观，且能把饮料中愉快风味渗入葛仙米。