本发明涉及一种海洋鱼类低聚肽在制备具有抑制肝癌细胞功效的药品、保健品或食品中的应用，所述海洋鱼类低聚肽中的组氨酸二肽含量为40‑100mg/100g；有机硒含量为1‑3mg/100g。通过药效实验证实，可以显著抑制肝癌细胞生长，能够应用于具有抑制肝癌细胞功效的药品、保健品或食品中。另外，鉴于海洋鱼类低聚肽还具有不含过敏源、安全性高，营养均衡，肽分子量小、吸收利用快，易溶于水等优点，便于与其它原料进行配伍，可以作为肝癌患者理想的功能性药品、保健品或食品或上述产品的配料。