本发明公开了一种食物中毒源DNA条形码数据库及其快速检测鉴定溯源方法，涉及生物工程技术领域，其包括以下步骤：步骤一：查阅文献资料及历年食物中毒资料，获取影响食品安全的鲀毒鱼、高生物胺水产品、有毒植物包括蘑菇的种属资料、地域分布特征及形态学信息。该食物中毒源DNA条形码数据库及其快速检测鉴定溯源方法，通过本研究创新性地在于其一提出面向食品安全、有效关联有毒动植物分类、致毒和形态的DNA条形码技术，其二对我国市场上可能包含有毒动植物的食品，进行快速鉴定应用研究，为研判与防控食源性疾病暴发事件提供技术支撑。通过基因筛查或全基因测序手段构建本地的病原谱，通过分子分型技术构建本地的分子分型数据库。