本发明涉及一种靶向过滤癌细胞的细胞印迹聚合物微球及其制备方法，属于生物工程技术领域。本发明所述制备方法包括：预聚合‑固定‑聚合‑洗脱‑罐装，五个步骤。本发明以一种癌细胞为印迹模板，丙烯酰胺为功能单体，乙二醇二甲基丙烯酸酯为交联剂，制备一种靶向过滤癌细胞的细胞印迹聚合物微球。本发明在治疗癌症过程中没有手术的创伤，减少患者痛苦及治疗所带来高昂的医疗费用，采用靶向过滤癌细胞的细胞印迹技术，通过对肿瘤患者进行血液中的癌细胞吸附清除治疗，能够有效的吸附并去除血液中的癌细胞，达到控制癌细胞的转移并抑制癌症的复发的目的。