本发明公开了本发明涉及一种以杂多糖为碳源生产内切β‑1,3‑葡聚糖酶的方法，属于发酵工程技术领域。本发明采用高果糖浆废液杂多糖代替葡萄糖利用毕赤酵母工程菌PGAP9K‑BGN13.1生产内切β‑1,3‑葡聚糖酶，为高果糖浆废液杂多糖提供了其在生物工程领域的价值，与葡萄糖做碳源相比，本发明的所述杂多糖做碳源发酵效果在相差无几的同时，发酵成本显著降低。