本发明公开了富含活性亚铁离子畜禽血寡肽的制备方法，步骤包括：1)分离血球与血清；2)均质破壁；3)血红蛋白溶液中加入复合蛋白酶，酶量为1.0～2.5％，搅拌转速为60～110转/分，酶解时间为4～7h后加入风味蛋白酶，酶量为0.3～0.8％，酶解时间为1～2h，搅拌转速为60～90转/分，酶解过程冲入氮气；4)将酶解液在9000～14000转/分的转速下沉降分离，制得酶解上清液和下层沉淀；5)将步骤4制得的上清液进行纳滤脱灰、浓缩处理，收集截留液；6)将截留液加入到步骤4制得的沉淀物中，同时加入包埋剂后冻干制粉。本发明制备方法简单、纯度高、经济效益突出，适合于大规模工业化生产。