本发明属于生物工程技术领域，具体涉及一种脑组织中与Mical2相互作用蛋白的鉴定方法。包括如下步骤：构建鼠脑组织mRNA文库；构建含有Mical2基因的融合表达载体，所述Mical2基因的核苷酸序列如SEQIDNo.1所示；利用酵母双杂交技术，将所述融合表达载体转化到感受态酵母中进行培养，然后与含有所述鼠脑组织mRNA文库的文库酵母进行混合培养；将所述混合培养后的培养液涂板，挑选单克隆菌落，筛选出与Mical2蛋白相互作用的蛋白质。通过该鉴定方法，在鼠脑中发现了125种可以与Mical2相互作用的蛋白质，这为进一步研究Mical2在脑组织中的功能指出了方向。