本发明涉及电芯制造技术领域，尤其涉及一种新能源电池自动化仓储物流系统，包括下层生产线、中层生产线和上层生产线，下层生产线包括有滚压分条机构和涂布机构，涂布机构的数量为两个，两个涂布机构分布在滚压分条机构的两侧，中层生产线包括有模切机构、叠片机构、焊极耳机构、包装机构、装框机构、高温静置I库和高温化成机构，叠片机构固定连接在叠片机构的右侧。该发明在整个设计过程中充分考虑三种托盘的外形尺寸及其特性来选择合理的输送方式，充分发挥常温存储I库和常温存储Ⅱ库作为缓存空托盘的作用，有效解决电芯在制作过程中因各个工序不对而造成托盘堵塞，并兼顾电芯的柔性装配速度，操作简便，其灵活性、装配效率高，易于控制。